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Text File  |  1995-03-04  |  3.7 KB  |  76 lines
  1. ****************************************************
  2. * Mitochondrial energy transfer proteins signature *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. Different types of substrate carrier  proteins involved in energy transfer are
  6. found in the inner mitochondrial membrane [1,2,3,4]. These are:
  7.  
  8.  - The ADP,ATP carrier protein (AAC)  (ADP/ATP translocase)  which exports ATP
  9.    into the  cytosol and  imports  ADP  into  the  mitochondrial  matrix.  The
  10.    sequence of AAC has been obtained from various mammalian, plant  and fungal
  11.    species.
  12.  - The  2-oxoglutarate/malate    carrier    protein  (OGCP),  which    exports
  13.    2-oxoglutarate into the cytosol and imports  malate  or  other dicarboxylic
  14.    acids into  the  mitochondrial matrix. This protein plays an important role
  15.    in several  metabolic  processes  such  as  the  malate/aspartate  and  the
  16.    oxoglutarate/isocitrate shuttles.
  17.  - The phosphate carrier protein, which transports  phosphate  groups from the
  18.    cytosol into the mitochondrial matrix.
  19.  - The brown fat uncoupling  protein (UCP) which dissipates  oxidative  energy
  20.    into heat by transporting protons  from  the cytosol into the mitochondrial
  21.    matrix.
  22.  - The  Grave's  disease  carrier protein (GDC), a protein of unknown function
  23.    by IgG in patients with active Grave's disease.
  24.  - Yeast mitochondrial proteins MRS3 and MRS4.  The exact  function  of  these
  25.    proteins is not known. They suppress a mitochondrial splice defect  in  the
  26.    first intron  of  the  COB  gene  and  may  act as carriers, exerting their
  27.    suppressor activity    by   modulating   solute   concentrations   in   the
  28.    mitochondrion.
  29.  - Yeast protein ACR1 [5],  which  seems  essential for  acetyl-CoA synthetase
  30.    activity.
  31.  - Yeast protein PMT1 [6].
  32.  - Yeast protein YMC1 [7].
  33.  
  34. Two other  proteins  have  been  found  to  belong to this family, yet are not
  35. localized in the mitochondrial inner membrane:
  36.  
  37.  - Maize    amyloplast   Brittle-1  protein  [8].  This  protein, found in the
  38.    endosperm of kernels, could play a role in amyloplast membrane transport.
  39.  - Candida  boidinii  peroxisomal  membrane  protein  PMP47  [9].  PMP47 is an
  40.    integral membrane  protein  of  the  peroxisome and it may play a role as a
  41.    transporter.
  42.  
  43. These proteins all seem to be evolutionary related. Structurally, they consist
  44. of three tandem repeats  of  a  domain of approximately  one hundred residues.
  45. Each of  these  domains  contains  two  transmembrane  regions. As a signature
  46. pattern, we selected one of the most conserved regions in the repeated domain,
  47. located just after the first transmembrane region.
  48.  
  49. -Consensus pattern: P-x-[DE]-x-[LIVAT]-[RK]-x-[LRH]-[LIVMFY]
  50. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  51.  for PMP47.
  52. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 185.   However,   in    all   these
  53.  proteins, the pattern is found only ONCE while it is found two to three times
  54.  in members of this family.
  55. -Last update: June 1994 / Text revised.
  56.  
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